病因尚未明了，可能與以下因素有關。

1.輸卵管異常

慢性輸卵管炎可導致管腔皺褶粘連、管腔部分阻塞；闌尾炎、盆腔結核、腹膜炎及子宮內膜異位癥可導致輸卵管周圍粘連、輸卵管扭曲和僵直，導致輸卵管狹窄、部分阻塞或者蠕動異常；盆腔腫瘤的牽拉和壓迫使輸卵管變得細長、迂曲或管腔部分阻塞、狹窄；輸卵管粘連分離術、再通術及傘端造口術后的重度粘連或手術部位瘢痕狹窄、輸卵管絕育術后瘺管形成或再通，均可延遲或者阻止受精卵進入宮腔，從而著床在輸卵管而發(fā)生輸卵管妊娠。此外，輸卵管發(fā)育不良時，輸卵管細長且迂曲，肌層發(fā)育差，黏膜纖毛缺乏，可影響受精卵的正常運行；輸卵管憩室或副傘等先天畸形亦可導致輸卵管妊娠。

2.受精卵游走

卵子在一側輸卵管受精，經宮腔進入對側輸卵管后種植（受精卵內游走）；或游走于腹腔內，被對側輸卵管拾揀（受精卵外游走），由于游走時間較長，受精卵發(fā)育增大，故種植對側輸卵管而成輸卵管妊娠。

3.避孕失敗

宮內節(jié)育器（IUD）避孕失敗而受孕時發(fā)生輸卵管妊娠的幾率增大。使用低劑量孕激素避孕藥時，可使輸卵管蠕動異常，如排卵未被抑制，可發(fā)生輸卵管妊娠；使用含有大量雌激素的緊急避孕藥避孕失敗而受孕者，發(fā)生輸卵管妊娠的幾率也增大。

4.其他

接受輔助生育技術治療不孕也可以發(fā)生輸卵管妊娠。內分泌異常、精神緊張也可導致輸卵管蠕動異常或痙攣而發(fā)生輸卵管妊娠。