氰化物可經由口服、吸入及皮膚黏膜被吸收到體內。氰化物由於可以抑制多種酶，被吸收後和細胞中線粒體（mitochondria）上細胞色素氧化酶（cytochrome oxidase）三價鐵離子產生絡合物，抑制細胞氧化磷酸化作用（oxidative phosphylation），阻斷能量ATP（adenosine triphosphate）的生成，并使得細胞缺氧窒息。

　　一般而言，對於微量的氰化物人體可藉由與變性血紅素（methemoglobin）作用，而不是與色素氧化酶結合的方式，而達到排除毒性的效果。而氰化變性血紅素（Cyanomethemoglobin）之後與一種硫化物轉移酶-硫氰酸生成酶 （rhodanese）作用，形成硫氰化銨（thiocyanate）錯合物。醫(yī)學|教育網|整理|硫氰化銨由腎臟排泄（也就是由尿液排出）。當過多的氰化物進入人體，前述反應機制無法負荷，因而產生毒性。