丹溪著書的態(tài)度十分嚴謹，至67歲時，著《格致余論》一書。不久又著《局方發(fā)揮》、《本草衍義補遺》、《傷寒論辨》、《外科精要發(fā)揮》等，今僅存前三部書。

《格致余論》是丹溪醫(yī)論的專著，醫(yī)學教|育網搜集整理共收醫(yī)論42篇，充分反映丹溪的學術思想，是丹溪的代表作之一。該書以《相火論》、《陽有余陰不足論》兩篇為中心內容，創(chuàng)立“陽常有余，陰常不足”的論點，強調保護陰氣的得要性，確立“滋陰降火”的治則，為倡導滋陰學說，打下牢固的基礎。其他各篇，側重論述滋陰降火和氣、血、痰、郁的觀點，內容十分豐富，每篇中又多以治驗相對照。

朱丹溪的醫(yī)學成就，主要是“相火論”、“陽有余陰不足論”，并在此基礎上，確立“滋陰降火”的治則，倡導滋陰學說及《局方發(fā)揮》一書，對雜病創(chuàng)氣、血、痰、郁的辨證方面。其他，如惡寒非寒、惡熱非熱之論，養(yǎng)老、慈幼、茹淡、節(jié)飲食、節(jié)情欲等論，大都從養(yǎng)陰出發(fā)，均對后世有深遠的影響。

丹溪學說，不僅在國內影響深遠，而且在15世紀時，由日本人月湖和田代三喜等傳入日本，日本又成立“丹溪學社”，進行研究和推廣。迄今日本沿存“丹溪學社”。

至正十八年（1358年）夏，一代醫(yī)學宗師朱丹溪與世長辭，終年78歲，葬于義烏東朱之郭頭庵。